Methoden Der Bioinformatik
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Methoden Der Bioinformatik
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Author : Marc-Thorsten Hütt
language : de
Publisher: Springer-Verlag
Release Date : 2015-12-01
Methoden Der Bioinformatik written by Marc-Thorsten Hütt and has been published by Springer-Verlag this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2015-12-01 with Computers categories.
Schritt für Schritt zu den Konzepten Die Autoren führen den Leser von den mathematischen Grundlagen zu den konkreten Methoden der Bioinformatik. Das Buch wendet sich damit an alle, die bioinformatische Methoden und Softwarepakete verwenden wollen, sie aber nicht als Black Boxes akzeptieren möchten. Ein besonderes Highlight ist die schrittweise Implementierung wichtiger Algorithmen der Bioinformatik im Computeralgebra-Programm Mathematica, um die Konzepte auch auf der informatischen Ebene zu verstehen. Das Themenspektrum reicht von bioinformatischen Alltagsfragen bis in die Systembiologie. Die zweite, stark erweiterte Auflage geht auch auf eine Reihe sehr aktueller Themen der Bioinformatik ein, etwa Next-Generation Sequencing (NGS), GWAS-Daten und Protein-Interaktions-Netzwerke. Der Inhalt ist spannend und leicht verständlich.
Methoden Der Bioinformatik
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Author : Marc-Thorsten Hütt
language : de
Publisher: Springer
Release Date : 2006-02-10
Methoden Der Bioinformatik written by Marc-Thorsten Hütt and has been published by Springer this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2006-02-10 with Science categories.
Die Autoren führen von den mathematischen Grundlagen zu den konkreten bioinformatischen Methoden und den fertigen Soft-warewerkzeugen. Ein besonderes Highlight sind die Mathematica-Exkurse. Schritt für Schritt wird die Implementierung wichtiger bioinformatischer Algorithmen im Computeralgebra-Programm Mathematica vorgeführt.
Bioinformatik
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Author : Gerhard Steger
language : de
Publisher: Springer-Verlag
Release Date : 2013-03-07
Bioinformatik written by Gerhard Steger and has been published by Springer-Verlag this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2013-03-07 with Medical categories.
Mit Hilfe der Bioinformatik können ermittelte DNA-, RNA- oder Aminosäuresequenzen hinsichtlich Struktur und Funktion schnell eingeschätzt werden; das spart Kosten und Zeit bei weiterführenden Experimenten im Labor. Das vorliegende Buch gliedert sich in einen RNA- und einen Protein-Teil. Je ein Kapitel führt das biologische Thema der Strukturvorhersage inklusive biophysikalischer Grundlagen der Vorhersagemethoden ein. Folgekapitel gehen auf die informationstechnischen Methoden mit einem möglichst kurzen Beispiel ein, stellen den meist komplizierteren Algorithmus zur Lösung des biologischen Problems vor und diskutieren zum Abschluss mindestens eine Implementation und damit erzielbare Ergebnisse anhand eines biologischen Beispiels. Das Buch ist gleichermassen für Biologen und Informatiker relevant, da es sowohl einen Überblick über die aktuellen Möglichkeiten der Strukturvorhersage gibt als auch den Einsatz von unterschiedlichsten informationstechnischen Methoden in der Biologie demonstriert.
Algorithmische Grundlagen Der Bioinformatik
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Author : Hans-Joachim Böckenhauer
language : de
Publisher: Vieweg+Teubner Verlag
Release Date : 2003-05-27
Algorithmische Grundlagen Der Bioinformatik written by Hans-Joachim Böckenhauer and has been published by Vieweg+Teubner Verlag this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2003-05-27 with Science categories.
Erlernen Sie die Grundlagen der Bioinformatik theoretisch fundiert und zugleich anschaulich mit vielen Beispielen. Die Bioinformatik hat in den vergangenen Jahren eine immer höhere Aufmerksamkeit erhalten. Dazu haben viele Großprojekten wie zum Beispiel das Human Genome Project beigetragen. Dieser Trend setzt sich durch immer neue und verfeinerte Ansätze zur Gewinnung und Analyse molekularbiologischer Daten fort.
Bioinformatik
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Author : Rainer Merkl
language : de
Publisher: John Wiley & Sons
Release Date : 2022-08-15
Bioinformatik written by Rainer Merkl and has been published by John Wiley & Sons this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2022-08-15 with Medical categories.
Bioinformatik Der Marktführer bei den Bioinformatiklehrbüchern in neuer Auflage und mit dem neuen Thema Molekulardynamik Bioinformatik ist eine Kerndisziplin in den modernen Biowssenschaften, von der Biotechnologie über die Biochemie und Molekularbiologie bis zur Molekulargenetik und Molekularmedizin. Sie ist eine essenzielle Grundlage für alle “omics”-Technologien, für die Strukturbiologie, die Systembiologie sowie die synthetische Biologie. Bioinformatik. Grundlagen, Algorithmen, Anwendungen bietet eine umfassende Einführung in die wichtigsten Methoden der Bioinformatik. Der Autor erklärt dabei sowohl die mathematischen und biologischen Grundlagen als auch die wichtigsten Software-Tools und deren Anwendungsbereiche. Schwerpunkte sind Methoden zum Sequenzvergleich, Verfahren zur Charakterisierung von Proteinfamilien, Algorithmen zur Vorhersage von Protein- und RNA-Strukturen, Methoden des maschinellen Lernens und das Proteindesign. Für die 4. Auflage wurde der Text durchgehend aktualisiert und um ein Kapitel zur Molekulardynamik erweitert. Neu aufgenommene Exkurse zu Meilensteinen der Bioinformatik und aktuellen Anwendungsgebieten lockern den Text auf. Auf der ebenfalls komplett überarbeiteten Begleit-Webseite werden interaktive Lernmodule bereitgestellt, einschließlich mehr als 120 Übungsaufgaben, zum Teil mit Lösungen. Eine perfekte Einführung für alle Studenten der Lebenswissenschaften oder Informatik, die einen Einblick in die gängigen Methoden der Bioinformatik benötigen, sowie ein wertvoller Begleiter für alle, die bereits bioinformatische Werkzeuge nutzen und die zugrundeliegenden Konzepte verstehen möchten.
Mathematische Methoden Der Bioinformatik Eine Einf Hrung
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Author : Werner Timischl
language : de
Publisher: Springer-Verlag
Release Date : 2024-02-26
Mathematische Methoden Der Bioinformatik Eine Einf Hrung written by Werner Timischl and has been published by Springer-Verlag this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2024-02-26 with Science categories.
Große Datenmengen lassen sich ohne den Einsatz von einschlägigen Softwareprodukten kaum bearbeiten. Mit den bereitgestellten Algorithmen können Daten statistisch ausgewertet und Optimierungsaufgaben oder kombinatorische Problemstellungen gelöst werden. Auch wenn dies zumeist im „Black Box“-Verfahren geschieht, ist es doch hilfreich, etwa bei der Auswahl der Algorithmen oder bei der Einschätzung der erforderlichen Zeit-Ressourcen, die hinter den Algorithmen steckenden mathematischen Ideen zu kennen. Das Buch lädt Biologen und Mediziner ein, sich mit den mathematischen Grundlagen von ausgewählten Algorithmen der Bioinformatik vertraut zu machen. Es ist eine Einführung mit vielen durchgerechneten Beispielen und zahlreichen Aufgaben mit ausführlichen Lösungen zum Einüben der mathematischen Inhalte. Inhaltliche Schwerpunkte sind Matrizen, lineare Gleichungssysteme, Rekursionen, Abzähltechniken, diskrete dynamische Optimierung, Markov-Ketten, Hidden Markov-Modelle und distanzbasierte Klassifikationsverfahren.
Bioinformatik Interaktiv
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Author : Rainer Merkl
language : de
Publisher: John Wiley & Sons
Release Date : 2003-08-08
Bioinformatik Interaktiv written by Rainer Merkl and has been published by John Wiley & Sons this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2003-08-08 with Computers categories.
Dieses Buch bietet eine Einführung in die wichtigsten Algorithmen der Bioinformatik. Schwerpunkte sind die Methoden des Sequenzvergleichs und Verfahren zur Charakterisierung von Proteinfamilien, insbesondere Hidden-Markov-Modelle. Daneben werden Algorithmen zur Vorhersage der Proteinraum-, Proteinsekundär- und RNA-Sekundärstruktur vorgestellt. Der Text ist in sich geschlossen; er vermittelt die für das Verständnis erforderlichen statistischen und biologischen Grundlagen sowie eine Einführung in Genetische Algorithmen und Neuronale Netze. Besonderer Wert wird auf die Vertiefung und Festigung der Kenntnisse durch praktisches Üben gelegt. Auf der Begleit-CD sind interaktive und internetbasierte Lektionen vorbereitet, deren Bearbeitung das Verständnis der relevanten Algorithmen wesentlich erleichtert. Sie führen in die Verwendung der wichtigsten Methoden ein und fördern die kritische Bewertung und Analyse der Verfahren und Ergebnisse. Zusätzlich können DNA- und Proteinraumstrukturen interaktiv untersucht werden. Der Text ist geeignet für alle, die sich einen Einblick in die gängigen Bioinformatik-Methoden verschaffen wollen: Studenten der Biologie oder Informatik und diejenigen, die bereits bioinformatische Werkzeuge nutzen und daran interessiert sind, die zugrundeliegenden Konzepte zu verstehen. "...Durch die hervorragend auf das Textbuch abgestimmten Übungen auf der beiliegenden CD werden dem Leser zusätzlich Erfahrungen bezüglich der Aussagekraft dieser Methoden vermittelt. Dadurch ist dieses Buch auf dem besten Weg, ein Studienbegleiter für alle Einsteiger in die Welt der Genomforschung und Informatik zu werden." Chemie in unserer Zeit
Mathematische Modelle Und Methoden Zur Genexpressionsanalyse In Der Bioinformatik
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Author : Frank Thierolf
language : de
Publisher: diplom.de
Release Date : 2003-09-19
Mathematische Modelle Und Methoden Zur Genexpressionsanalyse In Der Bioinformatik written by Frank Thierolf and has been published by diplom.de this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2003-09-19 with Mathematics categories.
Inhaltsangabe:Einleitung: Wie in vielen anderen Bereichen der Informatik, spielt auch in der Bioinformatik die Mathematik eine sehr bedeutende Rolle. Sie stellt Grundlagen, Modelle und Algorithmen bereit, die eine Problemlösung, Analyse oder Simulation in Form von Programmen überhaupt erst ermöglichen. Mit dieser Arbeit soll ein spezieller Teilbereich dieser mathematischen Grundlagen der Bioinformatik näher beleuchtet werden, nämlich mathematische Modelle und Methoden, die gegenwärtig bei der Analyse der Genexpression zum Einsatz kommen. Es entspricht hierbei nicht der Zielsetzung, die komplexen biologischen Vorgänge detailliert zu erläutern. Vielmehr sollen nur die für das Verständnis der mathematischen Aufgabenstellungen erforderlichen biologischen Grundlagen in ihren Grundzügen dargestellt werden. Diese Arbeit soll es dem Leser ermöglichen, auch ohne fundierte biologische Vorkenntnisse einen Eindruck davon zu gewinnen, was die moderne Mathematik im Bereich der Genexpressionsanalyse als Schnittstelle von Molekularbiologie und Informatik zu leisten im Stande ist. Gang der Untersuchung: Das Kapitel Biologische Grundlagen führt hierzu einige Grundbegriffe aus dem Bereich der Genetik - wie DNA, Proteine oder Genexpression - ein, deren Kenntnis für das Verständnis dieser Arbeit erforderlich sein wird. Ferner wird dargestellt, wie Versuchsergebnisse durch den Einsatz neuer Techniken wie DNA-Mikroarrays quantifizierbar und damit für mathematische Ansätze zugänglich gemacht werden. Daran schließt sich eine Betrachtung Boolescher Netzwerke als Modelle der Genregulation an. Nach Einführung einiger Grundlagen stehen unterschiedliche Algorithmen zur Netzwerkidentifikation im Zentrum der Betrachtung; so auch der Reverse-Engineering-Algorithmus (REVEAL) von Fuhrman, Liang und Somogyi. Im Kapitel Clustering-Methoden wird der häufig der Netzwerkidentifikation vorgeschaltete Prozess des Gen-Clustering erläutert. Hierbei wird dargestellt, wie aus dem gigantischen Vorrat an Genen diejenigen zur Betrachtung isoliert werden, die mit einem bestimmten zu untersuchenden Vorgang oder einer Krankheit in Verbindung stehen. Mit dem Unweighted-Pair-Grouping-Method-Algorithm und K-means werden exemplarisch sowohl eine hierarchische, wie auch eine nicht-hierarchische Clustering-Methode vorgestellt. Beispiele verdeutlichen die Arbeitsweise der Algorithmen. Mit Bayesianische Netzwerke als Modelle der Genregulation ist ein Kapitel überschrieben, welches einen [...]
Bioinformatik
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Author : Andrea Hansen
language : de
Publisher: Springer-Verlag
Release Date : 2013-03-07
Bioinformatik written by Andrea Hansen and has been published by Springer-Verlag this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2013-03-07 with Science categories.
Wie berechnet man multiple Alignments? Wie nutzt man eine Datenbank, um die mühsam im Labor ermittelten Sequenzen effektiv zu analysieren? Und welche Datenbank ist überhaupt am besten geeignet? Locker und leicht verständlich geschrieben führt dieser Leitfaden in die Geheimnisse der Bioinformatik ein, ohne dass man als Naturwissenschaftler gleich Informatik im Nebenfach belegt haben muss. Schwerpunkt des Buches sind die Grundlagen und verschiedenen Möglichkeiten der Sequenzanalyse. Das Buch beginnt mit einer Einführung in die wichtigen Sequenzdatendatenbanken am NCBI und EMBL sowie in die wachsende Zahl der Motivdatenbanken. Anschließend werden die einfachsten Methoden des paarweisen Sequenzvergleiches in globalen und lokalen Alignments beschrieben sowie die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (FASTA und BLAST). Multiple Alignments, Substitutionsmatrizen und die Berechnung phylogenetischer Bäume werden dem Leser nahe gebracht. Neu hinzugekommen sind auch Erläuterungen der Prinzipien der Genomanalyse und der gängigsten Algorithmen zur Genvorhersage. Zu jeder Methode werden Online-Tools im Internet oder freie Software angegeben. Der Leser wird so in die Lage versetzt, die beschriebenen Methoden selbstständig nachzuvollziehen. Die Autorin selbst ist Molekularbiologin und in der Bioinformatik-Branche tätig. Als ehemalige Betreuerin eines Bioinformatik-Kurses weiss sie aus eigener Erfahrung, auf welche Informationen es ankommt, um schnell und zielorientiert zu den gewünschten Ergebnissen zu gelangen. Das Buch richtet sich in erster Linie an Anwender und Einsteiger in die Bioinformatik. Angesprochen sind vor allem Studenten und Forscher aus allen Gebieten der Naturwissenschaften, die sich in Studium oder Beruf mit der Sequenzanalyse auseinandersetzen müssen. Gleichzeitig ist dieses Buch auch ein Leitfaden für all diejenigen, die die aufgeführten Methoden zwar regelmässig benutzen, aber noch nie die Zeit gefunden haben, sich mit den Grundlagen auseinanderzusetzen.
Einf Hrung In Die Bioinformatik
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Author : Horst D. Lohrer
language : de
Publisher: Springer Spektrum
Release Date : 2022-10-14
Einf Hrung In Die Bioinformatik written by Horst D. Lohrer and has been published by Springer Spektrum this book supported file pdf, txt, epub, kindle and other format this book has been release on 2022-10-14 with Science categories.
Dieses Lehrbuch bildet eine Brücke von der Biologie zur Bioinformatik. Die Methoden für die Erstellung klassischer Stammbäume werden zunächst resümiert, bevor DNA- und Protein-Sequenzen als digitalisierbare Merkmale den Übergang zu den Prinzipien der Bioinformatik ermöglichen. Der Vergleich von Sequenzen in Alignments bildet die Grundlage für molekulare Homologien, ermöglicht die Sequenzsuche in Datenbanken und erlaubt die Ableitung von molekularen Phylogenien. Die wesentlichen Prinzipien für moderne Anwendungen der Bioinformatik, wie Methoden von Transcriptomics und die Vorhersage von Protein-Strukturen, finden sich im letzten Kapitel. Aufgaben und ihre Lösungen ermuntern zur Anwendung der BIOinformatik und motivieren zu eigenen Fragestellungen.